El origen del actual Instituto Profesional Escuela de Marina Mercante Piloto Pardo se remonta al año 2011, cuando se presenta ante el Consejo Nacional de Educación (CNED) el proyecto institucional del entonces Instituto Mar Futuro, orientado a la formación de profesionales para la Marina Mercante chilena.

Mediante el Acuerdo N° 098/2011, de fecha 29 de septiembre de 2011, el CNED aprobó el plan y programa de estudios de la carrera de Ingeniería en Marina Mercante mención Puente, con una duración de ocho semestres académicos más práctica profesional. Sin embargo, la autorización definitiva para impartir la carrera quedó condicionada a la certificación de los recursos docentes, financieros, didácticos y de infraestructura necesarios.

Dicha certificación fue otorgada el 2 de enero de 2013, mediante el Acuerdo N° 004/2013, permitiendo el reconocimiento oficial del Instituto y la autorización para iniciar actividades académicas a contar del 18 de junio de 2013. La primera cohorte de estudiantes inició clases en marzo de 2014, en la sede ubicada en calle Freire Nº 520, Valparaíso.

Un hito clave en la historia institucional ocurre el 25 de febrero de 2016, cuando el Instituto es traspasado a la Fundación Almirante Carlos Condell, instancia en la que adopta su actual denominación: Instituto Profesional Escuela de Marina Mercante Piloto Pardo. En este mismo proceso, la institución traslada su casa central a su actual ubicación en Playa Ancha, Valparaíso, consolidando así una nueva etapa de desarrollo institucional.

Desde ese momento, el Instituto inicia un proceso sostenido de fortalecimiento académico, organizacional y normativo, ampliando su oferta académica con la incorporación de la carrera de Ingeniería en Marina Mercante mención Máquinas, ajustando su modelo educativo y avanzando progresivamente en la consolidación de su proyecto institucional, con foco en la formación de oficiales de la Marina Mercante conforme a los estándares nacionales e internacionales del sector marítimo.